Asgard (archeák)
 | Hasonló cikkcímek és megnevezések: Asgard (egyértelműsítő lap). |
 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Rendszertani besorolás | ||||||
| ||||||
| Törzsek | ||||||
| ||||||
| Hivatkozások | ||||||
 A Wikimédia Commons tartalmaz Asgard témájú kategóriát. |
Az Asgard egy javasolt főtörzs az archeák doménjében. Törzsei: Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota, Heimdallarchaeota.[1] A főtörzsbe tartozó egyik élőlényt sem sikerült még tenyészteni. Az Asgard rendszertani csoport az eukarióták legközelebbi prokarióta rokona.[2] Az eukarióták pedig valószínűleg az Asgard származási vonalból fejlődtek ki, miután szimbiózisra léptek egy alfa-proteobaktériummal. [2][3]
Osztályozás
Ennek a csoportnak a filogenetikai kapcsolata még mindig vitatott. A tagjainak a kapcsolata hozzávetőlegesen a következőː[2]
| Proteoarchaeota |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Az Asgard tagjai számos eukariótaszerű fehérjét kódolnak, beleértve GTPázokat, a membrán-remodellező fehérjéket, mint az ESCRT és az SNF7, egy ubiquitin módosító rendszert, és az N-glikozilációs útvonal homológjait.[4] Az Asgardok szabályozott aktin citoszkeletonnal rendelkeznek, és az általuk használt profilinek és gelsolinok kölcsönhatásba léphetnek az eukarióta aktinokkal.
Továbbá az Odinarchaeotaban talált tubulint (Odintubulin) valódi tubulinként azonosították. Az OdinTubulin az eukarióta mikrotubulusokhoz hasonló protomereket és protofilamentumokat képez, ugyanakkor az FtsZ-hez jobban hasonlító gyűrűrendszerekké áll össze, azt jelezve hogy az OdinTubulin az evolúció közbenső terméke lehet az FtsZ és a mikrotubulus-képző tubulinok között. A riboszómális fehérjéket kódoló génklaszterek vagy operonok gyakran kevésbé konzerváltak az Asgard-csoportban, mint más archeákban, ami arra utal, hogy a riboszomális fehérjéket kódoló gének sorrendje követheti a törzsfejlődést. [5]
Az Asgardok általában obligát anaerobok, bár a Kariarchaeota, Gerdarchaeota és a Hodarchaeota fakultatív aerobok lehetnek. Rendelkeznek a Wood–Ljungdahl útvonallal, és képesek glikolízisre. Tagjai lehetnek autotrófok, heterotrófok vagy fototrófok a heliorodopszin használatával. [6]
Az asgardok széles körben elterjedtek a világon, mind földrajzilag, mind élőhely szerint. Az ismert kládok közül sok üledékekre korlátozódik, míg a Lokiarchaeota, Thorarchaeota számos különböző élőhelyet foglal el. A sótartalom és a mélység fontos ökológiai tényező a legtöbb Asgard számára. Egyéb élőhelyek közé tartozik az állatok teste, a növények rizoszférája, a nem sós üledékek és talajok, a tengerfelszín és az édesvíz. [7]
A Heimdallarchaeota törzsről kiderült hogy N-terminális mag hisztonfarokkal rendelkezik, amely jellemzőről korábban azt hitték, hogy kizárólag eukariótáknál fordul elő. Később két másik archeális törzsben is találtak hisztonfarkat, egyikük sem az Asgard tagja.[8]
A Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum a Lokiarcheota egyik tagja két baktériumfajjal él szintrófiában.[9]
2023-ban Eme, Tamarit, Caceres és munkatársai arról számoltak be, hogy az eukarióták filogenetikailag mélyen Asgardon belül helyezkednek el, mint Hodarchaeales testvérei a Heimdallarchaeiában..[10]
| Proteoarchaeota |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Az ábrázolt forgatókönyvben az eukarióták filogenetikailag mélyen Asgard fájában vannak. Egy kedvelt forgatókönyv a szintrófia, ahol az egyik szervezet a másik táplálékától függ. Egy α-proteobaktérium a mitokondriummá vált.[12] Számos mai Asgard archaeák különböző szintrófiákat képeznek.[13]
A jelenleg elfogadott rendszertan a List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) listán[14] és az National Center for Biotechnology Information (NCBI) adatbázisán alapul.[15]
- Phylum Baldrarchaeota Caceres 2019
- Phylum Borrarchaeota Liu et al. 2021
- Phylum Freyrarchaeota corrig. Caceres 2019
- Phylum Friggarchaeota Caceres 2019
- Phylum Gefionarchaeota Caceres 2019
- Phylum Gerdarchaeota Cai et al. 2020
- Phylum Heimdallarchaeota Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2017
- Phylum Helarchaeota Seitz et al. 2019
- Phylum Hermodarchaeota Liu et al. 2021
- Phylum Hodarchaeota Liu et al. 2021
- Phylum Idunnarchaeota Caceres 2019
- Phylum Kariarchaeota Liu et al. 2021
- Phylum Lokiarchaeota Spang et al. 2015
- Phylum Njordarchaeota Xie et al. 2022
- Phylum Odinarchaeota Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2017
- Phylum Sifarchaeota Farag et al. 2020
- Phylum Sigynarchaeota Xie et al. 2022
- Phylum Thorarchaeota Baker 2015
- Phylum Tyrarchaeota Xie et al. 2022
- Phylum Wukongarchaeota Liu et al. 2021
Jegyzetek
- ↑ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna (2017. január 11.). „Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity” (angol nyelven). Nature 541 (7637), 353–358. o. DOI:10.1038/nature21031. ISSN 1476-4687.
- ↑ a b c Eme, Laura (2017. november 10.). „Archaea and the origin of eukaryotes” (angol nyelven). Nature Reviews Microbiology 15 (12), 711–723. o. DOI:10.1038/nrmicro.2017.133. ISSN 1740-1534.
- ↑ (2019. december 9.) „Phylogenomics provides robust support for a two-domains tree of life” (angol nyelven). Nature Ecology & Evolution 4 (1), 138–147. o. DOI:10.1038/s41559-019-1040-x. ISSN 2397-334X. PMID 31819234.
- ↑ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna, Jimmy H. (2017. január 19.). „Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity” (angol nyelven). Nature 541 (7637), 353–358. o. DOI:10.1038/nature21031. ISSN 0028-0836.
- ↑ (2023. október 1.) „Ribosomal Protein Cluster Organization in Asgard Archaea”. Archaea (Hindawi) 2023, 16. o. DOI:10.1155/2023/5512414.
- ↑ (2019. május 20.) „Asgard archaea: Diversity, function, and evolutionary implications in a range of microbiomes”. AIMS Microbiology 5 (1), 48–61. o. DOI:10.3934/microbiol.2019.1.48. PMID 31384702.
- ↑ (2021) „Ecological features and global distribution of Asgard archaea”. Science of the Total Environment 758, 143581. o. DOI:10.1016/j.scitotenv.2020.143581. ISSN 0048-9697. PMID 33223169.
- ↑ (2018. szeptember 1.) „Structure and function of archaeal histones”. PLOS Genetics 14 (9), e1007582. o. DOI:10.1371/journal.pgen.1007582. PMID 30212449.
- ↑ Zimmer, Carl. „This Strange Microbe May Mark One of Life's Great Leaps - A organism living in ocean muck offers clues to the origins of the complex cells of all animals and plants.”, The New York Times, 2020. január 15. (Hozzáférés: 2020. január 16.)
- ↑ (2023. június 14.) „Inference and reconstruction of the heimdallarchaeial ancestry of eukaryotes”. Nature 618 (7967), 992–999. o. DOI:10.1038/s41586-023-06186-2. PMID 37316666.
- ↑ The role of symbiosis in eukaryotic evolution, Origins and Evolution of Life: An astrobiological perspective. Cambridge: Cambridge University Press, 326–339. o. (2011). ISBN 978-0-521-76131-4
- ↑ (2019. július 1.) „Eukaryogenesis, a syntrophy affair”. Nature Microbiology 4 (7), 1068–1070. o. DOI:10.1038/s41564-019-0495-5. PMID 31222170.
- ↑ (2023. január 1.) „Actin cytoskeleton and complex cell architecture in an Asgard archaeon”. Nature 613 (7943), 332–339. o. DOI:10.1038/s41586-022-05550-y. ISSN 1476-4687. PMID 36544020.
- ↑ Euzéby, J.P.: Superphylum "Asgardarchaeota". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). (Hozzáférés: 2021. június 27.)
- ↑ Asgard group. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. (Hozzáférés: 2021. március 20.)
Biológiaportál • összefoglaló, színes tartalomajánló lap
