Amorphea

Amorphea
Periode Ektasium Awal - Masa kini, 1400–0 Ma
Had'n
Arkean
Proterozoikum
Pha.
IchthyosporeaAmebozoaNucleariidaFungusChoanoflegellateAnimal
Taksonomi
SuperdomainBiota
SuperkerajaanEukaryota
Tanpa nilaiAmorphea
Adl, 2012
Tata nama
Sinonim takson
  • Unikonta nom. nud.[1]
  • Opimoda Derelle et al., 2015[2]
Subkelompok
  • Obazoa
    • Breviatea
    • Apusomonadida
    • Opisthokonta
      • Holomycota
      • Holozoa
  • Amoebozoa
  • l
  • b
  • s

Amorphea[3] (sebelumnya Unikonta) adalah sebuah supergrup taksonomis yang mencakup Amoebozoa basal dan Obazoa. Obazoa sendiri mencakup Opisthokonta yang mencakup Fungi, Animalia dan Choanoflagellata. Afinitas taksonomi dari anggota-anggota klad ini awalnya dideskripsikan dan diusulkan oleh Thomas Cavalier-Smith pada 2002.[1][4]

Masyarakat Protistolog Internasional, badan taksonomi yang diakui untuk protozoa, menyarankan pada 2012, bahwa istilah Unikonta harus diganti menjadi Amorphea karena nama tersebut didasari oleh sinapomorfi yang dihipotesiskan, yang belakangan ditolak oleh penulis ISOP dan ilmuwan-ilmuwan lainnya.[3][5]

Kelompok ini mencakup amoebozoa, opisthokont,[6][7] dan Apusomonada.[8]

Pencirian

Amorphea memiliki fusi gen rangkap tiga yang tidak dapat ditemukan pada bikonta. Ketiga gen yang menyatu pada amorphea, mengkode enzium untuk sintese nukleotida pirimidin:sintese fosfat karbamoil, dihidroorotase, karbamoiltransferase aspartat. Hal tersebut seharunya melibatkan fusi ganda, yang merupakan sebuah peristiwa langka, mendukung leluhur bersama Opisthokonta dan Amoebozoa.

Klad

Kelompok ini mencakup sel eukariota yang, sebagian besar, memiliki satu flagela yang muncul, atau adalah amoeba tanpa flagela. Unikonta meliputi opisthokonta (hewan, jamur, dan bentuk terkait) dan Amoebozoa. Sebaliknya, kelompok eukariota lain yang lebih dikenal, yang lebih sering memiliki dua flagela yang muncul (meskipun ada banyak pengecualian), sering disebut sebagai bikonta. Bikonta meliputi Archaeplastida (tumbuhan dan kerabatnya) dan supergugus SAR, Cryptista, Haptista, Telonemia, dan picozoa.

Eukaryotes

Ancyromonadida

Malawimonada

CRuMs

Amorphea

Amoebozoa

Obazoa

Breviatea

Apusomonadida

Opisthokonta

Holomycota (inc. fungi)

Holozoa (inc. animals)

1300 mya
1500 mya
Diphoda

? Metamonada

Discoba

Diaphoretickes

Cryptista

Archaeplastida

Rhodophyta (red algae)

Picozoa

Glaucophyta

1100 mya

Viridiplantae (plants)

1000 mya
1600 mya

Hemimastigophora

Provora

Haptista

TSAR

Telonemia

SAR

Rhizaria

550 mya
Halvaria

Alveolata

go777

Bikonts
2200 mya

Satu pandangan tentang kerajaan besar dan kelompok batang mereka.[9][10][11][12] Metamonada sulit untuk ditempatkan, mungkin sebagai saudara dari Discoba, mungkin sebagai saudara dari Malawimonada.[12]

Referensi

  1. ^ a b Cavalier-Smith T (March 2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142. 
  2. ^ Derelle, Romain; Torruella, Guifré; Klimeš, Vladimír; Brinkmann, Henner; Kim, Eunsoo; Vlček, Čestmír; Lang, B. Franz; Eliáš, Marek (17 February 2015). "Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root". Proceedings of the National Academy of Sciences (dalam bahasa Inggris). 112 (7): E693–E699. Bibcode:2015PNAS..112E.693D. doi:10.1073/pnas.1420657112 alt=Dapat diakses gratis. PMC 4343179 alt=Dapat diakses gratis. PMID 25646484. 
  3. ^ a b c Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick RS, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (September 2012). "The revised classification of eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 59 (5): 429–93. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872 alt=Dapat diakses gratis. PMID 23020233. 
  4. ^ Cavalier-Smith, Thomas (2003). "Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa". European Journal of Protistology. 39 (4): 338–348. doi:10.1078/0932-4739-00002. 
  5. ^ Roger AJ, Simpson AG (2009). "Evolution: revisiting the root of the eukaryote tree". Current Biology. 19 (4): R165–R167. doi:10.1016/j.cub.2008.12.032 alt=Dapat diakses gratis. PMID 19243692.  Parameter |s2cid= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  6. ^ A Minge M, Silberman JD, Orr RJ, et al. (November 2008). "Evolutionary position of breviate amoebae and the primary eukaryote divergence". Proc. Biol. Sci. 276 (1657): 597–604. doi:10.1098/rspb.2008.1358. PMC 2660946 alt=Dapat diakses gratis. PMID 19004754. 
  7. ^ Burki F, Pawlowski J (October 2006). "Monophyly of Rhizaria and multigene phylogeny of unicellular bikonts". Mol. Biol. Evol. 23 (10): 1922–30. doi:10.1093/molbev/msl055. PMID 16829542. 
  8. ^ Burki, Fabien; Roger, Andrew J.; Brown, Matthew W.; Simpson, Alastair G. B. (2020-01-01). "The New Tree of Eukaryotes". Trends in Ecology & Evolution. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008 alt=Dapat diakses gratis. ISSN 0169-5347. PMID 31606140. 
  9. ^ Brown, Matthew W.; Heiss, Aaron A.; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo; Simpson, Alastair; Roger, Andrew (2018-01-19). "Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group". Genome Biology and Evolution. 10 (2): 427–433. doi:10.1093/gbe/evy014. PMC 5793813 alt=Dapat diakses gratis. PMID 29360967.  Parameter |name-list-style= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  10. ^ Schön ME, Zlatogursky VV, Singh RP, et al. (2021). "Picozoa are archaeplastids without plastid". Nature Communications. 12 (1): 6651. bioRxiv 10.1101/2021.04.14.439778 alt=Dapat diakses gratis Periksa nilai |biorxiv= (bantuan). doi:10.1038/s41467-021-26918-0. PMC 8599508 alt=Dapat diakses gratis Periksa nilai |pmc= (bantuan). PMID 34789758 Periksa nilai |pmid= (bantuan).  Parameter |s2cid= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  11. ^ Tikhonenkov DV, Mikhailov KV, Gawryluk RM, et al. (December 2022). "Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes". Nature. 612 (7941): 714–719. doi:10.1038/s41586-022-05511-5. PMID 36477531 Periksa nilai |pmid= (bantuan).  Parameter |s2cid= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  12. ^ a b Burki, Fabien; Roger, Andrew J.; Brown, Matthew W.; Simpson, Alastair G.B. (2020). "The New Tree of Eukaryotes". Trends in Ecology & Evolution. Elsevier BV. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008 alt=Dapat diakses gratis. ISSN 0169-5347. PMID 31606140.  Parameter |name-list-style= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan); Parameter |s2cid= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
  • l
  • b
  • s
Klasifikasi Eukariota
Domain
Arkea
Bakteria
Eukaryota
(Kerajaan
Tumbuhan
Hacrobia
Heterokontophyta
Alveolata
Rhizaria
Excavata
Amoebozoa
Hewan
Fungi)
Amorphea
Amoebozoa
   Obazoa   
Opisthokonta
Holomycota
   Holozoa   
  • Tunicaraptor
  • Bicellum
  • Ichthyosporea
  • Pluriformea
Filozoa
  • Filasterea
Choanozoa
Diaphoretickes
  • Provora
Haptista
    TSAR    
  • Telonemia
     SAR     
Rhizaria
Alveolata
Myzozoa
Stramenopila
  • Platysulcus
Bigyra
  • Bicosoecida
  • Placidozoa
  • Sagenista
Gyrista
     CAM     
Pan-Cryptista
  • Microheliella
Cryptista
  • Palpitomonas
  • Katablepharida
  • Cryptophyta
Archaeplastida
Viridiplantae
(tumbuhan sensu lato)
Streptophyta
Excavates*
Discoba
  • Jakobida
  • Tsukubamonas
Discicristata
Metamonada
  • Barthelona
  • Anaeramoebae
  • Anaeromonada
  • Fornicata
  • Parabasalia
Malawimonada
  • Malawimonadidae
  • Imasidae
Incertae sedis
Hemimastigophora
  • Spironemidae
  • Spironematellidae
Ancyromonadida
  • Ancyromonadidae
  • Planomonadidae
CRuMs
  • Collodictyonidae
  • Mantamonadida
  • Rigifilida