CLC

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1G86, 1HDK, 1LCL, 1QKQ

Ідентифікатори

Символи

CLC, GAL10, Gal-10, LGALS10, LGALS10A, LPPL_HUMAN, Charcot-Leyden crystal galectin, galectin-10

Зовнішні ІД

OMIM: 153310 HomoloGene: 130498 GeneCards: CLC

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • lysophospholipase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• multicellular organism development • T cell apoptotic process • regulation of T cell cytokine production • regulation of activated T cell proliferation • regulation of T cell anergy
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1178


н/д

Ensembl


ENSG00000105205


н/д

UniProt


Q05315


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001828


н/д

RefSeq (білок)


NP_001819


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 39.73 – 39.74 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

CLC (англ. Charcot-Leyden crystal galectin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 453^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLLPVPYTE	AASLSTGSTV	TIKGRPLACF	LNEPYLQVDF	HTEMKEESDI
VFHFQVCFGR	RVVMNSREYG	AWKQQVESKN	MPFQDGQEFE	LSISVLPDKY
QVMVNGQSSY	TFDHRIKPEA	VKMVQVWRDI	SLTKFNVSYL	KR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Dyer K.D., Handen J.S., Rosenberg H.F. (1997). The genomic structure of the human Charcot-Leyden crystal protein gene is analogous to those of the galectin genes. Genomics. 40: 217—221. PMID 9119387 DOI:10.1006/geno.1996.4590
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ghafouri B., Irander K., Lindbom J., Tagesson C., Lindahl M. (2006). Comparative proteomics of nasal fluid in seasonal allergic rhinitis. J. Proteome Res. 5: 330—338. PMID 16457599 DOI:10.1021/pr050341h
Chua J.C., Douglass J.A., Gillman A., O'Hehir R.E., Meeusen E.N. (2012). Galectin-10, a potential biomarker of eosinophilic airway inflammation. PLoS ONE. 7: E42549—E42549. PMID 22880030 DOI:10.1371/journal.pone.0042549
Swaminathan G.J., Leonidas D.D., Savage M.P., Ackerman S.J., Acharya K.R. (1999). Selective recognition of mannose by the human eosinophil Charcot-Leyden crystal protein (galectin-10): a crystallographic study at 1.8 A resolution. Biochemistry. 38: 13837—13843. PMID 10529229 DOI:10.1021/bi990756e

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2014 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q05315 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.