HLA-E

HLA-E
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3CII, 1KPR, 1KTL, 1MHE, 2ESV, 3AM8, 3BZE, 3BZF, 3CDG

Ідентифікатори
Символи HLA-E, EA1.2, EA2.1, HLA-6.2, MHC, QA1, major histocompatibility complex, class I, E
Зовнішні ІД OMIM: 143010 MGI: 2442805 HomoloGene: 134018 GeneCards: HLA-E
Онтологія гена
Молекулярна функція

beta-2-microglobulin binding
MHC class I protein binding
signaling receptor binding
natural killer cell lectin-like receptor binding
peptide antigen binding
T cell receptor binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
phagocytic vesicle membrane
early endosome membrane
мембрана
MHC class Ib protein complex
Golgi membrane
клітинна мембрана
cell surface
MHC class I protein complex
ER to Golgi transport vesicle membrane
integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane
екзосома
recycling endosome membrane

Біологічний процес

antigen processing and presentation
адаптивна імунна відповідь
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent
CD8-positive, alpha-beta T cell activation
interferon-gamma-mediated signaling pathway
процес імунної системи
antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I
positive regulation of T cell mediated cytotoxicity
positive regulation of TRAIL production
positive regulation of interleukin-4 production
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent
protection from natural killer cell mediated cytotoxicity
positive regulation of interleukin-13 production
type I interferon signaling pathway
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
regulation of natural killer cell mediated immunity
positive regulation of natural killer cell mediated immunity
regulation of immune response
positive regulation of tumor necrosis factor production
вроджений імунітет
positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation
antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class Ib

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3133
667803
Ensembl
ENSG00000204592
ENSG00000225201
ENSG00000236632
ENSG00000230254
ENSG00000206493
ENSG00000233904
ENSG00000229252
ENSMUSG00000073405
UniProt
P13747
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_005516
NM_001271005
RefSeq (білок)
NP_005507
н/д
Локус (UCSC) Хр. 6: 30.49 – 30.49 Mb Хр. 17: 36.42 – 36.42 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HLA-E (англ. Major histocompatibility complex, class I, E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот, а молекулярна маса — 40 157[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVDGTLLLLLSEALALTQTWAGSHSLKYFHTSVSRPGRGEPRFISVGYVD
DTQFVRFDNDAASPRMVPRAPWMEQEGSEYWDRETRSARDTAQIFRVNLR
TLRGYYNQSEAGSHTLQWMHGCELGPDRRFLRGYEQFAYDGKDYLTLNED
LRSWTAVDTAAQISEQKSNDASEAEHQRAYLEDTCVEWLHKYLEKGKETL
LHLEPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQQDGEGHTQDTE
LVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPVTLRWKPASQ
PTIPIVGIIAGLVLLGSVVSGAVVAAVIWRKKSSGGKGGSYSKAEWSDSA
QGSESHSL

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ohya K., Kondo K., Mizuno S. (1990). Polymorphism in the human class I MHC locus HLA-E in Japanese. Immunogenetics. 32: 205—209. PMID 1977695 DOI:10.1007/BF02114975
  • Mizuno S., Trapani J.A., Koller B.H., Dupont B., Yang S.Y. (1988). Isolation and nucleotide sequence of a cDNA clone encoding a novel HLA class I gene. J. Immunol. 140: 4024—4030. PMID 3131426
  • Koller B.H., Geraghty D.E., Shimizu Y., Demars R., Orr H.T. (1988). HLA-E. A novel HLA class I gene expressed in resting T lymphocytes. J. Immunol. 141: 897—904. PMID 3260916

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4962 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, P13747 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»