MMP28

Ідентифікатори

Символи

MMP28, EPILYSIN, MM28, MMP-25, MMP-28, MMP25, matrix metallopeptidase 28

Зовнішні ІД

OMIM: 608417 MGI: 2153062 HomoloGene: 41559 GeneCards: MMP28

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • міжклітинний простір
Біологічний процес	• протеоліз • negative regulation of macrophage chemotaxis • extracellular matrix organization • collagen catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79148


118453

Ensembl


ENSG00000278843 ENSG00000271447


ENSMUSG00000020682

UniProt


Q9H239


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001032278 NM_024302 NM_032950


NM_080453 NM_172797 NM_001320300

RefSeq (білок)


NP_001027449 NP_077278 NP_116568 NP_116568.1


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 35.76 – 35.8 Mb

Хр. 11: 83.33 – 83.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MMP28 (англ. Matrix metallopeptidase 28) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 58 939^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVARVGLLLR	ALQLLLWGHL	DAQPAERGGQ	ELRKEAEAFL	EKYGYLNEQV
PKAPTSTRFS	DAIRAFQWVS	QLPVSGVLDR	ATLRQMTRPR	CGVTDTNSYA
AWAERISDLF	ARHRTKMRRK	KRFAKQGNKW	YKQHLSYRLV	NWPEHLPEPA
VRGAVRAAFQ	LWSNVSALEF	WEAPATGPAD	IRLTFFQGDH	NDGLGNAFDG
PGGALAHAFL	PRRGEAHFDQ	DERWSLSRRR	GRNLFVVLAH	EIGHTLGLTH
SPAPRALMAP	YYKRLGRDAL	LSWDDVLAVQ	SLYGKPLGGS	VAVQLPGKLF
TDFETWDSYS	PQGRRPETQG	PKYCHSSFDA	ITVDRQQQLY	IFKGSHFWEV
AADGNVSEPR	PLQERWVGLP	PNIEAAAVSL	NDGDFYFFKG	GRCWRFRGPK
PVWGLPQLCR	AGGLPRHPDA	ALFFPPLRRL	ILFKGARYYV	LARGGLQVEP
YYPRSLQDWG	GIPEEVSGAL	PRPDGSIIFF	RDDRYWRLDQ	AKLQATTSGR
WATELPWMGC	WHANSGSALF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Marchenko G.N., Strongin A.Y. (2001). MMP-28, a new human matrix metalloproteinase with an unusual cysteine-switch sequence is widely expressed in tumors. Gene. 265: 87—93. PMID 11255011 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00360-2
Lohi J., Wilson C.L., Roby J.D., Parks W.C. (2001). Epilysin, a novel human matrix metalloproteinase (MMP-28) expressed in testis and keratinocytes and in response to injury. J. Biol. Chem. 276: 10134—10144. PMID 11121398 DOI:10.1074/jbc.M001599200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14366 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H239 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.