SERPIND1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1JMO, 1JMJ, 2NAT

Ідентифікатори

Символи

SERPIND1, D22S673, HC2, HCF2, HCII, HLS2, LS2, THPH10, serpin family D member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 142360 MGI: 96051 HomoloGene: 36018 GeneCards: SERPIND1

Пов'язані генетичні захворювання

heparin cofactor 2 deficiency^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity • endopeptidase inhibitor activity • heparin binding • serine-type endopeptidase inhibitor activity
Клітинна компонента	• екзосома • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region
Біологічний процес	• negative regulation of peptidase activity • біолюмінесценція • гемостаз • хемотаксис • зсідання крові • negative regulation of endopeptidase activity • посттрансляційна модифікація
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3053


15160

Ensembl


ENSG00000099937


ENSMUSG00000022766

UniProt


P05546


P49182

RefSeq (мРНК)


NM_000185


NM_008223 NM_001331047

RefSeq (білок)


NP_000176


NP_001317976 NP_032249

Локус (UCSC)

Хр. 22: 20.77 – 20.79 Mb

Хр. 16: 17.15 – 17.16 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SERPIND1 (англ. Serpin family D member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 57 071^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKHSLNALLI	FLIITSAWGG	SKGPLDQLEK	GGETAQSADP	QWEQLNNKNL
SMPLLPADFH	KENTVTNDWI	PEGEEDDDYL	DLEKIFSEDD	DYIDIVDSLS
VSPTDSDVSA	GNILQLFHGK	SRIQRLNILN	AKFAFNLYRV	LKDQVNTFDN
IFIAPVGIST	AMGMISLGLK	GETHEQVHSI	LHFKDFVNAS	SKYEITTIHN
LFRKLTHRLF	RRNFGYTLRS	VNDLYIQKQF	PILLDFKTKV	REYYFAEAQI
ADFSDPAFIS	KTNNHIMKLT	KGLIKDALEN	IDPATQMMIL	NCIYFKGSWV
NKFPVEMTHN	HNFRLNEREV	VKVSMMQTKG	NFLAANDQEL	DCDILQLEYV
GGISMLIVVP	HKMSGMKTLE	AQLTPRVVER	WQKSMTNRTR	EVLLPKFKLE
KNYNLVESLK	LMGIRMLFDK	NGNMAGISDQ	RIAIDLFKHQ	GTITVNEEGT
QATTVTTVGF	MPLSTQVRFT	VDRPFLFLIY	EHRTSCLLFM	GRVANPSRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз, світлочутливих білків. Задіяний у таких біологічних процесах як зсідання крові, гемостаз, хемотаксис, люмінесценція. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину.

Література

Blinder M.A., Marasa J.C., Reynolds C.H., Deaven L.L., Tollefsen D.M. (1988). Heparin cofactor II: cDNA sequence, chromosome localization, restriction fragment length polymorphism, and expression in Escherichia coli. Biochemistry. 27: 752—759. PMID 2894851 DOI:10.1021/bi00402a039
Ragg H. (1986). A new member of the plasma protease inhibitor gene family. Nucleic Acids Res. 14: 1073—1088. PMID 3003690 DOI:10.1093/nar/14.2.1073
Inhorn R.C., Tollefsen D.M. (1986). Isolation and characterization of a partial cDNA clone for heparin cofactor II1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 137: 431—436. PMID 3755044 DOI:10.1016/0006-291X(86)91228-3
Griffith M.J., Noyes C.M., Tyndall J.A., Church F.C. (1985). Structural evidence for leucine at the reactive site of heparin cofactor II. Biochemistry. 24: 6777—6782. PMID 3907702 DOI:10.1021/bi00345a008
Baglin T.P., Carrell R.W., Church F.C., Esmon C.T., Huntington J.A. (2002). Crystal structures of native and thrombin-complexed heparin cofactor II reveal a multistep allosteric mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 11079—11084. PMID 12169660 DOI:10.1073/pnas.162232399
Ragg H., Preibisch G. (1988). Structure and expression of the gene coding for the human serpin hLS2. J. Biol. Chem. 263: 12129—12134. PMID 2841345

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SERPIND1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4838 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P05546 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.