SNUPN

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1XK5, 2P8Q, 2Q5D, 2QNA, 3GB8, 3GJX, 3LWW, 3NBY, 3NBZ, 3NC0

Ідентифікатори

Символи

SNUPN, KPNBL, RNUT1, Snurportin1, snurportin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607902 MGI: 1913319 HomoloGene: 4166 GeneCards: SNUPN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA cap binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear import signal receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ядерна пора • клітинне ядро • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• snRNA import into nucleus • protein import into nucleus • spliceosomal snRNP assembly • import into nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10073


66069

Ensembl


ENSG00000169371


ENSMUSG00000055334

UniProt


O95149


Q80W37

RefSeq (мРНК)


NM_005701 NM_001042581 NM_001042588


NM_178374

RefSeq (білок)


NP_001036046 NP_001036053 NP_005692


NP_848461

Локус (UCSC)

Хр. 15: 75.6 – 75.63 Mb

Хр. 9: 56.86 – 56.89 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNUPN (англ. Snurportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 41 143^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELSQALAS	SFSVSQDLNS	TAAPHPRLSQ	YKSKYSSLEQ	SERRRRLLEL
QKSKRLDYVN	HARRLAEDDW	TGMESEEENK	KDDEEMDIDT	VKKLPKHYAN
QLMLSEWLID	VPSDLGQEWI	VVVCPVGKRA	LIVASRGSTS	AYTKSGYCVN
RFSSLLPGGN	RRNSTAKDYT	ILDCIYNEVN	QTYYVLDVMC	WRGHPFYDCQ
TDFRFYWMHS	KLPEEEGLGE	KTKLNPFKFV	GLKNFPCTPE	SLCDVLSMDF
PFEVDGLLFY	HKQTHYSPGS	TPLVGWLRPY	MVSDVLGVAV	PAGPLTTKPD
YAGHQLQQIM	EHKKSQKEGM	KEKLTHKASE	NGHYELEHLS	TPKLKGSSHS
PDHPGCLMEN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
Strasser A., Dickmanns A., Luehrmann R., Ficner R. (2005). Structural basis for m3G-cap-mediated nuclear import of spliceosomal UsnRNPs by snurportin1. EMBO J. 24: 2235—2243. PMID 15920472 DOI:10.1038/sj.emboj.7600701
Mitrousis G., Olia A.S., Walker-Kopp N., Cingolani G. (2008). Molecular basis for the recognition of snurportin 1 by importin beta. J. Biol. Chem. 283: 7877—7884. PMID 18187419 DOI:10.1074/jbc.M709093200
Bhardwaj A., Cingolani G. (2010). Conformational selection in the recognition of the snurportin importin beta binding domain by importin beta. Biochemistry. 49: 5042—5047. PMID 20476751 DOI:10.1021/bi100292y

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14245 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O95149 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.