Vilardin

Vilardin
Nazivi

Cvet biljke Mariosousa willardiana
IUPAC naziv 3-(2,4-Diokso-3,4-dihidropirimidin-1(2H)-il)-L-alanin
Sistemski IUPAC naziv (2S)-2-Amino-3-(2,4-diokso-3,4-dihidropirimidin-1(2H)-il)propanoinska kiselina
Drugi nazivi 3-(Uracil-1-il)-L-alanin 3-(1-Uracil)-L-alanin
Identifikacija
CAS broj	19772-76-0
3D model (Jmol)	interaktivna slika
Bajlštajn	20710
ChEBI	CHEBI:15851
ChemSpider	389063
DrugBank	DB04129
KEGG^[1]	C03584
MeSH	Willardiine
PubChem^[2]^[3] C ID	440053

SMILES C1=CN(C(=O)NC1=O)C[C@@H](C(=O)O)N
Svojstva
Hemijska formula	C₇H₉N₃O₄
Molarna masa	199,17 g·mol⁻¹
log P	−4.4
Kiselost (pK_a)	2.97
Baznost (pK_b)	9.76
Ukoliko nije drugačije napomenuto, podaci se odnose na standardno stanje materijala (na 25 °C [77 °F], 100 kPa).
Reference infokutije

Vilardin ili (S)-1-(2-amino-2-karboksietil)pirimidin-2,4-dion je hemijsko jedinjenje koje se prirodno nalazi u semenu Mariosousa willardiana i Acacia sensu lato.^[4] Sadnice ovih biljaka sadrže enzime sposobne za složene hemijske supstitucije koje rezultiraju stvaranjem slobodnih aminokiselina. Vilardin se često proučava zbog njegove funkcije u biljkama višeg nivoa. Pored toga, mnogi derivati vilardina su istraženi zbog njihovog potencijala u farmaceutskom razvoju.^[4] Vilardin je prvi otkrio 1959. R. Gmelin, kada je izolovao nekoliko slobodnih, neproteinskih aminokiselina iz Acacia willardiana (drugi naziv za Mariosousa willardiana) kada je proučavao kako ove porodice biljaka sintetišu uracilialanine.^[5] Srodno jedinjenje, izovilardin, je istovremeno izolovala jedna druga grupa, i otkriveno je da ova dva jedinjenja imaju različita strukturna i funkcionalna svojstva.^[6] Naknadna istraživanja vilardiina fokusirala su se na funkcionalni značaj različitih supstitucija na azotnoj grupi i na razvoj analoga vilardina sa različitim farmakokinetičkim svojstvima. Generalno, vilardin je jedno od prvih proučavanih jedinjenja kod kojih male promene molekularne strukture rezultiraju jedinjenjima sa značajno različitim farmakokinetičkim svojstvima.^[7]

Vilardin je parcijalni agonist jonotropnih glutamatnih receptora. Ovi receptori se nalaze u ekscitatornim sinapsama i vezuju glutamat (glavni ekscitatorni neurotransmiter) i strukturno slične ligande. Aktivacija receptora dovodi do priliva pozitivnih jona u neuron, što dovodi do neuralne depolarizacije. Vilardin specifično agonizuje ne-NMDA glutamatne receptore: AMPA i kainatne receptore.^[6]

Razvijeni su analozi vilardina koji imaju različite afinitete vezivanja za AMPA i kainatne receptore. Ovi analozi su korišćeni za proučavanje strukture ovih receptora, kao i funkcionalnog značaja aktivacije receptora u različitim regionima mozga.^[7] Dok vilardin i njegovi analozi nisu eksplicitno proučavani kao terapeutici, postoji niz neuroloških poremećaja koje karakterišu promene u glutamatnoj signalizaciji, a ligandi za AMPA i kainatne receptore se često proučavaju kao potencijalni terapeutici.^[8]

Reference

^ Joanne Wixon; Douglas Kell (2000). „Website Review: The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes — KEGG”. Yeast. 17 (1): 48—55. doi:10.1002/(SICI)1097-0061(200004)17:1<48::AID-YEA2>3.0.CO;2-H.
^ Li Q, Cheng T, Wang Y, Bryant SH (2010). „PubChem as a public resource for drug discovery.”. Drug Discov Today. 15 (23-24): 1052—7. PMID 20970519. doi:10.1016/j.drudis.2010.10.003. уреди
^ Evan E. Bolton; Yanli Wang; Paul A. Thiessen; Stephen H. Bryant (2008). „Chapter 12 PubChem: Integrated Platform of Small Molecules and Biological Activities”. Annual Reports in Computational Chemistry. 4: 217—241. doi:10.1016/S1574-1400(08)00012-1.
^ ^а ^б Viso, Alma; Fernández de la Pradilla, Roberto; García, Ana; Flores, Aida (август 2005). „α,β-Diamino Acids: Biological Significance and Synthetic Approaches”. Chemical Reviews (на језику: енглески). 105 (8): 3167—3196. ISSN 0009-2665. PMID 16092828. doi:10.1021/cr0406561. CS1 одржавање: Формат датума (веза)
^ Kjær, Anders; Knudsen, Allan; Larsen, P. Olesen (1961). „Amino acid studies. Part IV. Structure and synthesis of the plant amino acid willardiine [3-(1-uracyl)-L-alanine].”. Acta Chemica Scandinavica. 15: 1193—1195. ISSN 0904-213X. doi:10.3891/acta.chem.scand.15-1193 .
^ ^а ^б Traynelis, Stephen F.; Wollmuth, Lonnie P.; McBain, Chris J.; Menniti, Frank S.; Vance, Katie M.; Ogden, Kevin K.; Hansen, Kasper B.; Yuan, Hongjie; Myers, Scott J.; Dingledine, Ray (септембар 2010). Sibley, David, ур. „Glutamate Receptor Ion Channels: Structure, Regulation, and Function”. Pharmacological Reviews (на језику: енглески). 62 (3): 405—496. ISSN 0031-6997. PMC 2964903 . PMID 20716669. doi:10.1124/pr.109.002451. CS1 одржавање: Формат датума (веза)
^ ^а ^б Bunch, Lennart; Krogsgaard‐Larsen, Povl (2009). „Subtype selective kainic acid receptor agonists: Discovery and approaches to rational design”. Medicinal Research Reviews (на језику: енглески). 29 (1): 3—28. ISSN 1098-1128. PMID 18623169. S2CID 11112717. doi:10.1002/med.20133.
^ Matute, Carlos (2011). „Therapeutic Potential of Kainate Receptors”. CNS Neuroscience & Therapeutics (на језику: енглески). 17 (6): 661—669. ISSN 1755-5949. PMC 3430855 . PMID 21129167. doi:10.1111/j.1755-5949.2010.00204.x.

Glutamatergični ligandi

Jonotropni

AMPA	Agonisti: 5-Fluoro-vilardin • AMPA • Domoična kiselina • Kuiskualinska kiselina; Pozitivni alosterni modulatori: Aniracetam • Ciklotiazid • CX-516 • CX-546 • CX-614 • CX-691 • CX-717 • Diazoksid • HCTZ • IDRA-21 • LY-392,098 • LY-404,187 • LY-451,395 • LY-451,646 • LY-503,430 • Oksiracetam • PEPA • Piracetam • Pramiracetam • S-18986 • Sunifiram • Unifiram Antagonisti: ATPO • Karoverin • CNQX • DNQX • GYKI-52466 • NBQX • Perampanel • Talampanel • Tezampanel; Negativni alosterni modulatori: GYKI-53,655
NMDA	Agonisti: Konkurentni agonisti: Aspartat • Glutamat • Homohinolinska kiselina • Ibotenska kiselina • NMDA • Hinolinska kiselina • Tetrazolilglicin; Agonisti glicinskog mesta: ACBD • ACPC • ACPD • Alanin • CCG • Cikloserin • DHPG • Fluoroalanin • Glicin • HA-966 • L-687,414 • Milacemid • Sarkozin • Serin • Tetrazolilglicin; Agonisti poliaminskog mesta: Akamprosat • Spermidin • Spermin Antagonisti: Konkurentni antagonisti: AP5 (APV) • AP7 • CGP-37849 • CGP-39551 • CGP-39653 • CGP-40116 • CGS-19755 • CPP • LY-233,053 • LY-235,959 • LY-274,614 • MDL-100,453 • Midafotel (d-CPPen) • NPC-12,626 • NPC-17,742 • PBPD • PEAQX • Perzinfotel • PPDA • SDZ-220581 • Selfotel; Nekonkurentni antagonisti: ARR-15,896 • Karoverin • Deksanabinol • FPL-12495 • FR-115,427 • Hodgkinsin • Magnezijum • MDL-27,266 • NPS-1506 • Psihotridin • Cink; Nekonkurentni blokatori pora: 2-MDP • 3-MeO-PCP • 8A-PDHQ • Amantadin • Aptiganel • ARL-12,495 • ARL-15,896-AR • ARL-16,247 • Budipin • Delucemin • Deksoksadrol • Dekstralorfan • Dieticiklidin • Dizocilpin • Endopsihozin • Esketamin • Etoksadrol • Eticiklidin • Gaciklidin • Ibogain • Indantadol • Ketamin • Ketobemidon • Loperamid • Memantin • Meperidin (Petidin) • Metadon • Metorfan (Dekstrometorfan, Levometorfan) • Metoksetamin • Milnacipran • Morfanol (Dekstrorfan, Levorfanol) • NEFA • Nerameksan • Azotsuboksid • Noribogain • Orfenadrin • PCPr • Fenciklamin • Fenciklidin • Propoksifen • Remacemid • Rinhofilin • Riluzol • Rimantadin • Roliciklidin • Sabeluzol • Tenociklidin • Tiletamin • Tramadol • Ksenon; Antagonisti glicinskog mesta: ACEA-1021 • ACEA-1328 • Karisoprodol • CGP-39653 • CKA • DCKA • Felbamat • Gavestinel • GV-196,771 • Kinurenska kiselina • L-689,560 • L-701,324 • Lakosamid • Likostinel • LU-73,068 • MDL-105,519 • Meprobamat • MRZ 2/576 • PNQX • ZD-9379; Antagonisti NR2B podjedinice: Bezonprodil • CO-101,244 (PD-174,494) • CP-101,606 • Eliprodil • Haloperidol • Ifenprodil • Izoksuprin • Nilidrin • Ro8-4304 • Ro25-6981 • Traksoprodil; Neklasifikovani/nesortirani antagonisti: Hloroform • Dietil etar • Enfluran • Etanol (Alkohol) • Halotan • Izofluran • Metoksifluran • Toluen • Trihloroetan • Trihloroetanol • Trihloroetilen • Ksilen
Kainat	Agonisti: 5-Jodovilardin • ATPA • Domoična kiselina • Kainska kiselina • LY-339,434 • SYM-2081 Antagonisti: CNQX • DNQX • LY-382,884 • NBQX • NS102 • UBP-302; Negativni alosterni modulatori: NS-3763

Metabotropni

Grupa I	Agonisti: Neselektivni: ACPD • DHPG • Kuiskualinska kiselina; mGlu1-selektivni: Ro01-6128 • Ro67-4853 • Ro67-7476 • VU-71; mGlu5-selektivni: ADX-47273 • CDPPB • CHPG • DFB • VU-1545 Antagonisti: Neselektivni: MCPG • NPS-2390; mGlu1-selektivni: BAY 36-7620 • CPCCOEt • LY-367,385 • LY-456,236; mGlu5-selektivni: DMeOB • Fenobam • LY-344,545 • MPEP • MTEP • SIB-1757 • SIB-1893
Grupa II	Agonisti: Neselektivni: CBiPES • DCG-IV • Eglumegad • LY-379,268 • LY-404,039 • LY-487,379 • MGS-0028; mGlu2-selektivni: BINA • LY-566,332 Antagonisti: Neselektivni: APICA • EGLU • HYDIA • LY-307,452 • LY-341,495 • MCPG • MGS-0039; mGlu2-selektivni: PCCG-4; mGlu3-selektivni: CECXG; Negativni alosterni modulatori: RO4491533
Grupa III	Agonisti: Neselektivni: L-AP4; mGlu4-selektivni: PHCCC • VU-001,171 • VU-0155,041; mGlu7-selektivni: AMN082; mGlu8-selektivni: DCPG Antagonisti: Neselektivni: CPPG • MAP4 • MSOP • MPPG • MTPG • UBP-1112; mGlu7-selektivni: MMPIP

Inhibitori
transporta

EAAT	DHKA • PDC • WAY-213,613
vGluT	7-CKA • Evansovo plavo

п р у Modulatori jonotropnog glutamatnog receptora
AMPAR	Agonisti: Agonisti glavnog mesta: 5-Fluorovilardin Akromelična kiselina (akromelat) AMPA BOAA Domoinska kiselina Glutamat Ibotenska kiselina Prolin Kuiskualinska kiselina Vilardin; Pozitivni alosterni modulatori: Aniracetam Ciklotiazid CX-516 CX-546 CX-614 Farampator (CX-691, ORG-24448) CX-717 CX-1739 CX-1942 Diazoksid Hidrohlorotiazid (HTZ) IDRA-21 LY-392098 LY-395153 LY-404187 LY-451646 LY-503430 Mibampator (LY-451395) Nooglutil ORG-26576 Oksiracetam PEPA PF-04958242 Piracetam Pramiracetam S-18986 Tulrampator (S-47445, CX-1632) Antagonisti: ACEA-1011 ATPO Bekampanel Karoverin CNQX Dazolampanel DNQX Fanapanel (MPQX) GAMS Kaitocefalin Kinurenska kiselina Kinurenin Likostinel (ACEA-1021) NBQX PNQX Selurampanel Tezampanel Teanin Topiramat YM90K Zonampanel; Negativni alosterni modulatori: Barbiturati (npr. pentobarbital, natrijum tiopental) Ciklopropan Enfluran Etanol (alkohol) Evansovo plavo GYKI-52466 GYKI-53655 Halotan Irampanel Izofluran Perampanel Pregnenolon sulfat Sevofluran Talampanel; Nepoznati/nerazvrstani antagonisti: Minociklin
KAR	Agonisti: Agonisti glavnog mesta: 5-Bromovilardin 5-Jodovilardin Akromelična kiselina (akromelat) AMPA ATPA Domoinska kiselina Glutamat Ibotenska kiselina Kainska kiselina LY-339434 Prolin Kuiskualinska kiselina SYM-2081; Pozitivni alosterni modulatori: Ciklotiazid Diazoksid Enfluran Halotan Izofluran Antagonisti: ACEA-1011 CNQX Dazolampanel DNQX GAMS Kaitocefalin Kinurenska kiselina Likostinel (ACEA-1021) LY-382884 NBQX NS102 Selurampanel Tezampanel Teanin Topiramat UBP-302; Negativni alosterni modulatori: Barbiturati (npr. pentobarbital, natrijum tiopental) Enfluran Etanol (alkohol) Evansovo plavo NS-3763 Pregnenolon sulfat
NMDAR	Agonisti: Agonisti glavnog mesta: AMAA Aspartat Glutamat Homocisteinska kiselina (L-HCA) Homohinolinska kiselina Ibotenska kiselina NMDA Prolin Hinolinska kiselina Tetrazolilglicin Teanin; Agonisti glicinovog mesta: β-fluoro-D-alanin ACBD ACC (ACPC) ACPD AK-51 Apimostinel (NRX-1074) B6B21 CCG D-Alanin D-Cikloserin D-Serin DHPG Dimetilglicin Glicin HA-966 L-687414 L-Alanin L-Serin Milacemid Neboglamin (nebostinel) Rapastinel (GLYX-13) Sarkozin; Agonisti poliaminovog mesta: Neomicin Spermidin Spermin; Ostali pozitivni alosterni modulatori: 24S-hidroksiholesterol DHEA (prasteron) DHEA sulfat (prasteron sulfat) Epipregnanolon sulfat Pregnenolon sulfat SAGE-201 SAGE-301 SAGE-718 Antagonisti: Kompetitivni antagonisti: AP5 (APV) AP7 CGP-37849 CGP-39551 CGP-39653 CGP-40116 CGS-19755 CPP Kaitocefalin LY-233053 LY-235959 LY-274614 MDL-100453 Midafotel (d-CPPen) NPC-12626 NPC-17742 PBPD PEAQX Perzinfotel PPDA SDZ-220581 Selfotel; Antagonisti glicinovog mesta: 4-Cl-KYN (AV-101) 5,7-DCKA 7-CKA ACC ACEA-1011 ACEA-1328 Apimostinel (NRX-1074) AV-101 Karisoprodol CGP-39653 CNQX D-Cikloserin DNQX Felbamat Gavestinel GV-196771 Harkoserid Kinurenska kiselina Kinurenin L-689560 L-701324 Likostinel (ACEA-1021) LU-73068 MDL-105519 Meprobamat MRZ 2/576 PNQX Rapastinel (GLYX-13) ZD-9379; Antagonisti poliaminovog mesta: Arkain Co 101676 Diaminopropan Dietilentriamin Huperzin A Putrescin; Nekompetitivni blokatori pora (uglavnom dizocilpinovo mesto): 2-MDP 3-HO-PCP 3-MeO-PCE 3-MeO-PCMo 3-MeO-PCP 4-MeO-PCP 8A-PDHQ 18-MC α-Endopsihozin Alaproklat Alazocin (SKF-10047) Amantadin Aptiganel Argiotoksin-636 Arketamin ARL-12495 ARL-15896-AR ARL-16247 Budipin Koronaridin Delucemin (NPS-1506) Deksoksadrol Dekstralorfan Dekstrometadon Dekstrometorfan Dekstrorfan Dieticiklidin Difenidin Dizocilpin Efenidin Esketamin Etoksadrol Eticiklidin Fluorolintan Gaciklidin Ibogain Ibogamin Indantadol Ketamin Ketobemidon Lanicemin Levometadon Levometorfan Levomilnacipran Levorfanol Loperamid Memantin Metadon Metorfan Metoksetamin Metoksfenidin Milnacipran Morfanol NEFA Nerameksan Nitromemantin Noribogain Norketamin Orfenadrin PCPr PD-137889 Petidin (meperidin) Fenciklamin Fenciklidin Propoksifen Remacemid Rinhofilin Rimantadin Roliciklidin Sabeluzol Tabernantin Tenociklidin Tiletamin Tramadol; Antagonisti ifenprodilovog (NR2B) mesta: Besonprodil Bufenin (nilidrin) CO-101244 (PD-174494) Eliprodil Haloperidol Izoksuprin Radiprodil (RGH-896) Rislenemdaz (CERC-301, MK-0657) Ro 8-4304 Ro 25-6981 Safaprodil Traksoprodil (CP-101606); NR2A-selektivni antagonisti: MPX-004 MPX-007 TCN-201 TCN-213; Katjoni: Vodonik Magnezijum Cink; Alkoholi / isparljivi anestetici / povezani: Benzen Butan Hloroform Ciklopropan Desfluran Dietil eter Enfluran Etanol (alkohol) Halotan Heksanol Izofluran Metoksifluran Azotni oksid Oktanol Sevofluran Toluen Trihloroetan Trihloroetanol Trihloroetilen Uretan Ksenon Ksilen; Nepoznati/nerazvrstani antagonisti: ARR-15896 Bumetanid Karoverin Konantokin D-αAA Deksanabinol Flufenaminska kiselina Flupirtin FPL-12495 FR-115427 Furosemid Hodžkinsin Ipenoksazon (MLV-6976) MDL-27266 Metafit Minociklin MPEP Nifluminska kiselina Pentamidin Pentamidin isetionat Piretanid Psihotridin Transkrocetin (šafran)