Ламін B1

Ламін B1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2KPW, 3JT0, 3TYY, 3UMN

Ідентифікатори
Символи LMNB1, ADLD, LMN, LMN2, LMNB, lamin B1, MCPH26
Зовнішні ІД OMIM: 150340 MGI: 96795 HomoloGene: 55912 GeneCards: LMNB1
Пов'язані генетичні захворювання
adult-onset autosomal dominant demyelinating leukodystrophy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

phospholipase binding
structural molecule activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
double-stranded DNA binding
sequence-specific double-stranded DNA binding

Клітинна компонента

nuclear matrix
nuclear inner membrane
ядерна мембрана
мембрана
Проміжні філаменти
lamin filament
нуклеоплазма
клітинне ядро
nuclear envelope

Біологічний процес

interleukin-12-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4001
16906
Ensembl
ENSG00000113368
ENSMUSG00000024590
UniProt
P20700
P14733
RefSeq (мРНК)
NM_001198557
NM_005573
NM_010721
RefSeq (білок)
NP_001185486
NP_005564
NP_034851
Локус (UCSC) Хр. 5: 126.78 – 126.84 Mb Хр. 18: 56.84 – 56.89 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Ламін B1 (англ. Lamin B1) – білок, який кодується геном LMNB1, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 66 408[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATATPVPPRMGSRAGGPTTPLSPTRLSRLQEKEELRELNDRLAVYIDKV
RSLETENSALQLQVTEREEVRGRELTGLKALYETELADARRALDDTARER
AKLQIELGKCKAEHDQLLLNYAKKESDLNGAQIKLREYEAALNSKDAALA
TALGDKKSLEGDLEDLKDQIAQLEASLAAAKKQLADETLLKVDLENRCQS
LTEDLEFRKSMYEEEINETRRKHETRLVEVDSGRQIEYEYKLAQALHEMR
EQHDAQVRLYKEELEQTYHAKLENARLSSEMNTSTVNSAREELMESRMRI
ESLSSQLSNLQKESRACLERIQELEDLLAKEKDNSRRMLTDKEREMAEIR
DQMQQQLNDYEQLLDVKLALDMEISAYRKLLEGEEERLKLSPSPSSRVTV
SRASSSRSVRTTRGKRKRVDVEESEASSSVSISHSASATGNVCIEEIDVD
GKFIRLKNTSEQDQPMGGWEMIRKIGDTSVSYKYTSRYVLKAGQTVTIWA
ANAGVTASPPTDLIWKNQNSWGTGEDVKVILKNSQGEEVAQRSTVFKTTI
PEEEEEEEEAAGVVVEEELFHQQGTPRASNRSCAIM

Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

  • Lin F., Worman H.J. (1995). Structural organization of the human gene (LMNB1) encoding nuclear lamin B1. Genomics. 27: 230—236. PMID 7557986 DOI:10.1006/geno.1995.1036
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Farnsworth C.C., Wolda S.L., Gelb M.H., Glomset J.A. (1989). Human lamin B contains a farnesylated cysteine residue. J. Biol. Chem. 264: 20422—20429. PMID 2684976

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з Ламін B1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6637 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 30 січня 2017.
  5. UniProt, P20700 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські