KIF16B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/62/KIF16B.png/250px-KIF16B.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KIF16B, C20orf23, KISC20ORF, SNX23, kinesin family member 16B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 618171 MGI: 1098240 HomoloGene: 135708 GeneCards: KIF16B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ileal neoplasm[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • microtubule motor activity • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • microtubule binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • phosphatidylinositol binding • plus-end-directed microtubule motor activity • ATP binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding • ATPase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • early endosome membrane • мембрана • Кінезин • early endosome • мікротрубочка • цитоскелет • гіалоплазма • phagocytic vesicle |
---|
Біологічний процес | • endoderm development • epidermal growth factor receptor signaling pathway • Golgi to endosome transport • receptor catabolic process • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • microtubule-based movement • early endosome to late endosome transport • formation of primary germ layer • regulation of receptor recycling • cellular response to interferon-gamma |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9f/PBB_GE_C20orf23_gnf1h01829_at_fs.png/250px-PBB_GE_C20orf23_gnf1h01829_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/02/PBB_GE_C20orf23_219570_at_fs.png/250px-PBB_GE_C20orf23_219570_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001199865 NM_001199866 NM_024704 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186794 NP_001186795 NP_078980 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 16.27 – 16.57 Mb | Хр. 2: 142.62 – 142.9 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KIF16B (англ. Kinesin family member 16B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 317 амінокислот, а молекулярна маса — 152 011[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASVKVAVRV | | RPMNRREKDL | | EAKFIIQMEK | | SKTTITNLKI | | PEGGTGDSGR |
ERTKTFTYDF | | SFYSADTKSP | | DYVSQEMVFK | | TLGTDVVKSA | | FEGYNACVFA |
YGQTGSGKSY | | TMMGNSGDSG | | LIPRICEGLF | | SRINETTRWD | | EASFRTEVSY |
LEIYNERVRD | | LLRRKSSKTF | | NLRVREHPKE | | GPYVEDLSKH | | LVQNYGDVEE |
LMDAGNINRT | | TAATGMNDVS | | SRSHAIFTIK | | FTQAKFDSEM | | PCETVSKIHL |
VDLAGSERAD | | ATGATGVRLK | | EGGNINKSLV | | TLGNVISALA | | DLSQDAANTL |
AKKKQVFVPY | | RDSVLTWLLK | | DSLGGNSKTI | | MIATISPADV | | NYGETLSTLR |
YANRAKNIIN | | KPTINEDANV | | KLIRELRAEI | | ARLKTLLAQG | | NQIALLDSPT |
ALSMEEKLQQ | | NEARVQELTK | | EWTNKWNETQ | | NILKEQTLAL | | RKEGIGVVLD |
SELPHLIGID | | DDLLSTGIIL | | YHLKEGQTYV | | GRDDASTEQD | | IVLHGLDLES |
EHCIFENIGG | | TVTLIPLSGS | | QCSVNGVQIV | | EATHLNQGAV | | ILLGRTNMFR |
FNHPKEAAKL | | REKRKSGLLS | | SFSLSMTDLS | | KSRENLSAVM | | LYNPGLEFER |
QQREELEKLE | | SKRKLIEEME | | EKQKSDKAEL | | ERMQQEVETQ | | RKETEIVQLQ |
IRKQEESLKR | | RSFHIENKLK | | DLLAEKEKFE | | EERLREQQEI | | ELQKKRQEEE |
TFLRVQEELQ | | RLKELNNNEK | | AEKFQIFQEL | | DQLQKEKDEQ | | YAKLELEKKR |
LEEQEKEQVM | | LVAHLEEQLR | | EKQEMIQLLR | | RGEVQWVEEE | | KRDLEGIRES |
LLRVKEARAG | | GDEDGEELEK | | AQLRFFEFKR | | RQLVKLVNLE | | KDLVQQKDIL |
KKEVQEEQEI | | LECLKCEHDK | | ESRLLEKHDE | | SVTDVTEVPQ | | DFEKIKPVEY |
RLQYKERQLQ | | YLLQNHLPTL | | LEEKQRAFEI | | LDRGPLSLDN | | TLYQVEKEME |
EKEEQLAQYQ | | ANANQLQKLQ | | ATFEFTANIA | | RQEEKVRKKE | | KEILESREKQ |
QREALERALA | | RLERRHSALQ | | RHSTLGMEIE | | EQRQKLASLN | | SGSREQSGLQ |
ASLEAEQEAL | | EKDQERLEYE | | IQQLKQKIYE | | VDGVQKDHHG | | TLEGKVASSS |
LPVSAEKSHL | | VPLMDARINA | | YIEEEVQRRL | | QDLHRVISEG | | CSTSADTMKD |
NEKLHNGTIQ | | RKLKYERMVS | | RSLGANPDDL | | KDPIKISIPR | | YVLCGQGKDA |
HFEFEVKITV | | LDETWTVFRR | | YSRFREMHKT | | LKLKYAELAA | | LEFPPKKLFG |
NKDERVIAER | | RSHLEKYLRD | | FFSVMLQSAT | | SPLHINKVGL | | TLSKHTICEF |
SPFFKKGVFD | | YSSHGTG |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендосомах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF16B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15869 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96L93 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
| Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
| Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
| Незгруповані альфа | |
---|
| Не-альфа | |
---|
|
---|
| Тип 3 | |
---|
| Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
| Тип 5 | |
---|
|
---|
| Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
| Катеніни | |
---|
| Мембранні | |
---|
| Інші | |
---|
|
---|
| Нелюдські | |
---|
|