TPM1

Ідентифікатори

Символи

TPM1, C15orf13, CMD1Y, CMH3, HTM-alpha, LVNC9, TMSA, HEL-S-265, tropomyosin 1 (alpha), tropomyosin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 191010 HomoloGene: 121635 GeneCards: TPM1

Пов'язані генетичні захворювання

hypertrophic cardiomyopathy 3, dilated cardiomyopathy 1Y, гіпертрофічна кардіоміопатія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytoskeletal protein binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • structural constituent of muscle • identical protein binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • actin filament binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • muscle thin filament tropomyosin • саркомера • stress fiber • ruffle membrane • bleb • цитоскелет • гіалоплазма • мікрофіламент • actin cytoskeleton • міофібрила • filamentous actin
Біологічний процес	• regulation of muscle contraction • м'язове скорочення • regulation of heart contraction • positive regulation of ATP-dependent activity • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell migration • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • ruffle organization • Загоєння ран • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • negative regulation of cell migration • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • muscle filament sliding • sarcomere organization • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of cell adhesion • actin filament organization • in utero embryonic development • positive regulation of heart rate by epinephrine • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • cardiac muscle contraction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7168


415209

Ensembl


ENSG00000140416


ENSDARG00000104682

UniProt


P09493


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_000366 NM_001018004 NM_001018005 NM_001018006 NM_001018007
NM_001018008 NM_001018020 NM_001301244 NM_001301289 NM_001330344 NM_001330346 NM_001330351 NM_001365776 NM_001365777 NM_001365778 NM_001365779 NM_001365780 NM_001365781 NM_001365782


NM_001002119

RefSeq (білок)

NP_000357 NP_001018004 NP_001018005 NP_001018006 NP_001018007
NP_001018008 NP_001018020 NP_001288173 NP_001288218 NP_001317273 NP_001317275 NP_001317280 NP_001352705 NP_001352706 NP_001352707 NP_001352708 NP_001352709 NP_001352710 NP_001352711 NP_001018006.1


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 15: 63.04 – 63.07 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TPM1 (англ. Tropomyosin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 32 709^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDAIKKKMQM	LKLDKENALD	RAEQAEADKK	AAEDRSKQLE	DELVSLQKKL
KGTEDELDKY	SEALKDAQEK	LELAEKKATD	AEADVASLNR	RIQLVEEELD
RAQERLATAL	QKLEEAEKAA	DESERGMKVI	ESRAQKDEEK	MEIQEIQLKE
AKHIAEDADR	KYEEVARKLV	IIESDLERAE	ERAELSEGKC	AELEEELKTV
TNNLKSLEAQ	AEKYSQKEDR	YEEEIKVLSD	KLKEAETRAE	FAERSVTKLE
KSIDDLEDEL	YAQKLKYKAI	SEELDHALND	MTSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Mische S.M., Manjula B.N., Fischetti V.A. (1987). Relation of streptococcal M protein with human and rabbit tropomyosin: the complete amino acid sequence of human cardiac alpha tropomyosin, a highly conserved contractile protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 142: 813—818. PMID 3548719 DOI:10.1016/0006-291X(87)91486-0
Lin C.-S., Leavitt J. (1988). Cloning and characterization of a cDNA encoding transformation-sensitive tropomyosin isoform 3 from tumorigenic human fibroblasts. Mol. Cell. Biol. 8: 160—168. PMID 3336357 DOI:10.1128/MCB.8.1.160
McLeod A.R., Gooding C. (1988). Human hTM alpha gene: expression in muscle and nonmuscle tissue. Mol. Cell. Biol. 8: 433—440. PMID 3336363 DOI:10.1128/MCB.8.1.433
Denz C.R., Narshi A., Zajdel R.W., Dube D.K. (2004). Expression of a novel cardiac-specific tropomyosin isoform in humans. Biochem. Biophys. Res. Commun. 320: 1291—1297. PMID 15249230 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.06.084
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Houle F., Poirier A., Dumaresq J., Huot J. (2007). DAP kinase mediates the phosphorylation of tropomyosin-1 downstream of the ERK pathway, which regulates the formation of stress fibers in response to oxidative stress. J. Cell Sci. 120: 3666—3677. PMID 17895359 DOI:10.1242/jcs.003251

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12010 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P09493 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Білки цитоскелету

Людські

Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки

Міофіламенти

Актин	A1 A2 B C1 G1 G2

Міозин	I A B C D E F G H II 1 2 3 4 6 7 7B 8 9 10 11 13 14 15 16 III A B V A B C VI MYO6 VII A B IX A B X MYO10 XV A B XVIII A B Легкий ланцюг міозину 1 2 3 4 5 6 6B 7 9 10 12A 12B IP K K2 K3 K4 L1 PF

Інші	Тропомодулін 1 2 3 4 Тропонін T 1 2 3 C 1 2 I 1 2 3 Тропоміозин 1 2 3 4 Актинін 1 2 3 4 Комплекс Arp2/3 актин-деполімеризуючі фактори Кофілін 1 2 дестрин Гелсолін Профілін 1 2 Тітин

Інші

WAS
Фібрилін
Філамін
- A
- B
- C
Еспін
TRIOBP

Проміжні філаменти

Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)

Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 10 12 13 14 15 16 17 19 20 хромосома 12 18 інші 21 тип II/хромосома 12 1 2 3 4 5 6A 6B 7 8 9

Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини)	тип I/хромосома 17 31 32 33A 33B 34 35 36 37 38 тип II/хромосома 12 81 82 83 84 85 86

Незгруповані альфа	хромосома 17 23 24 25 26 27 28 39 40 хромосома 12 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80

Не-альфа	Бета-кератин

Тип 3

Тип 4

Інтернексин
Нестин
Нейрофіламент
- NEFL
- NEFM
- NEFH
Синемін
Синкоїлін

Тип 5

Ламіни: A/C
B1
B2

Мікротрубочки
та пов'язані білки

Тубулін	1A 1B 1C 3C 3D 3E 4A 8

Кінезин	1A 1B 2A 2C 3B 3C 4A 4B 5A 5B 5C 6 7 9 11 12 13A 13B 14 15 16B 17 18A 18B 19 20A 20B 21A 21B 22 23 24 25 26A 26B 27 C1 C2 C3

Динеїн	аксонемні: 1 2 3 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 17 I1 I2 LI1 L1 L4 цитоплазматичні: C1H1 C2H1 C1I1 C1I2 C1LI1 C1LI2 C2LI1 LL1 LL2 LRB1 LRB2 LT1 LT3

Інші	MAPT DCTN1 STMN1 Тектин 1 2 3 4 5 Динамін 1 2 3