NFAT5

NFAT5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1IMH

Ідентифікатори
Символи NFAT5, NF-AT5, NFATL1, NFATZ, OREBP, TONEBP, nuclear factor of activated T-cells 5, tonicity-responsive, nuclear factor of activated T-cells 5, nuclear factor of activated T cells 5
Зовнішні ІД OMIM: 604708 MGI: 1859333 HomoloGene: 4811 GeneCards: NFAT5
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
transcription factor binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
цитоплазма
гіалоплазма
transcription regulator complex

Біологічний процес

regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade
GO:0032617 cytokine production
GO:1901313 positive regulation of gene expression
виділення
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
calcineurin-NFAT signaling cascade
response to osmotic stress
cellular response to cytokine stimulus
positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10725
54446
Ensembl
ENSG00000102908
ENSMUSG00000003847
UniProt
O94916
Q9WV30
RefSeq (мРНК)
NM_001113178
NM_006599
NM_138713
NM_138714
NM_173214
NM_173215
NM_001367709
NM_001286260
NM_018823
NM_133957
RefSeq (білок)
NP_001106649
NP_006590
NP_619727
NP_619728
NP_775321
NP_775322
NP_001354638
NP_001273189
NP_061293
NP_598718
Локус (UCSC) Хр. 16: 69.57 – 69.7 Mb Хр. 8: 108.02 – 108.11 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NFAT5 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 531 амінокислот, а молекулярна маса — 165 763[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPSDFISLLSADLDLESPKSLYSRESVYDLLPKELQLPPSRETSVASMSQ
TSGGEAGSPPPAVVAADASSAPSSSSMGGACSSFTTSSSPTIYSTSVTDS
KAMQVESCSSAVGVSNRGVSEKQLTSNTVQQHPSTPKRHTVLYISPPPED
LLDNSRMSCQDEGCGLESEQSCSMWMEDSPSNFSNMSTSSYNDNTEVPRK
SRKRNPKQRPGVKRRDCEESNMDIFDADSAKAPHYVLSQLTTDNKGNSKA
GNGTLENQKGTGVKKSPMLCGQYPVKSEGKELKIVVQPETQHRARYLTEG
SRGSVKDRTQQGFPTVKLEGHNEPVVLQVFVGNDSGRVKPHGFYQACRVT
GRNTTPCKEVDIEGTTVIEVGLDPSNNMTLAVDCVGILKLRNADVEARIG
IAGSKKKSTRARLVFRVNIMRKDGSTLTLQTPSSPILCTQPAGVPEILKK
SLHSCSVKGEEEVFLIGKNFLKGTKVIFQENVSDENSWKSEAEIDMELFH
QNHLIVKVPPYHDQHITLPVSVGIYVVTNAGRSHDVQPFTYTPDPAAAGA
LNVNVKKEISSPARPCSFEEAMKAMKTTGCNLDKVNIIPNALMTPLIPSS
MIKSEDVTPMEVTAEKRSSTIFKTTKSVGSTQQTLENISNIAGNGSFSSP
SSSHLPSENEKQQQIQPKAYNPETLTTIQTQDISQPGTFPAVSASSQLPN
SDALLQQATQFQTRETQSREILQSDGTVVNLSQLTEASQQQQQSPLQEQA
QTLQQQISSNIFPSPNSVSQLQNTIQQLQAGSFTGSTASGSSGSVDLVQQ
VLEAQQQLSSVLFSAPDGNENVQEQLSADIFQQVSQIQSGVSPGMFSSTE
PTVHTRPDNLLPGRAESVHPQSENTLSNQQQQQQQQQQVMESSAAMVMEM
QQSICQAAAQIQSELFPSTASANGNLQQSPVYQQTSHMMSALSTNEDMQM
QCELFSSPPAVSGNETSTTTTQQVATPGTTMFQTSSSGDGEETGTQAKQI
QNSVFQTMVQMQHSGDNQPQVNLFSSTKSMMSVQNSGTQQQGNGLFQQGN
EMMSLQSGNFLQQSSHSQAQLFHPQNPIADAQNLSQETQGSLFHSPNPIV
HSQTSTTSSEQMQPPMFHSQSTIAVLQGSSVPQDQQSTNIFLSQSPMNNL
QTNTVAQEAFFAAPNSISPLQSTSNSEQQAAFQQQAPISHIQTPMLSQEQ
AQPPQQGLFQPQVALGSLPPNPMPQSQQGTMFQSQHSIVAMQSNSPSQEQ
QQQQQQQQQQQQQQQQSILFSNQNTMATMASPKQPPPNMIFNPNQNPMAN
QEQQNQSIFHQQSNMAPMNQEQQPMQFQSQSTVSSLQNPGPTQSESSQTP
LFHSSPQIQLVQGSPSSQEQQVTLFLSPASMSALQTSINQQDMQQSPLYS
PQNNMPGIQGATSSPQPQATLFHNTAGGTMNQLQNSPGSSQQTSGMFLFG
IQNNCSQLLTSGPATLPDQLMAISQPGQPQNEGQPPVTTLLSQQMPENSP
LASSINTNQNIEKIDLLVSLQNQGNNLTGSF

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Miyakawa H., Woo S.K., Dahl S.C., Handler J.S., Kwon H.M. (1999). Tonicity-responsive enhancer binding protein, a rel-like protein that stimulates transcription in response to hypertonicity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 2538—2542. PMID 10051678 DOI:10.1073/pnas.96.5.2538
  • Lopez-Rodriguez C., Aramburu J., Rakeman A.S., Rao A. (1999). NFAT5, a constitutively nuclear NFAT protein that does not cooperate with Fos and Jun. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 7214—7219. PMID 10377394 DOI:10.1073/pnas.96.13.7214
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zuehlke C., Kiehl R., Johannsmeyer A., Grzeschik K.H., Schwinger E. (1999). Isolation and characterization of novel CAG repeat containing genes expressed in human brain. DNA Seq. 10: 1—6. PMID 10565538 DOI:10.3109/10425179909033929
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7774 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, O94916 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші