NKX3-2

NKX3-2
Ідентифікатори
Символи NKX3-2, NK3 homeobox 2, BAPX1, NKX3.2, NKX3B, SMMD
Зовнішні ІД OMIM: 602183 MGI: 108015 HomoloGene: 68168 GeneCards: NKX3-2
Пов'язані генетичні захворювання
spondylo-megaepiphyseal-metaphyseal dysplasia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

animal organ development
skeletal system development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
digestive system development
intestinal epithelial cell development
skeletal system morphogenesis
negative regulation of apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
spleen development
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
embryonic skeletal system development
animal organ formation
determination of left/right symmetry
negative regulation of chondrocyte differentiation
middle ear morphogenesis
pancreas development
диференціація клітин
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
579
12020
Ensembl
ENSG00000109705
ENSMUSG00000049691
UniProt
P78367
P97503
RefSeq (мРНК)
NM_001189
NM_007524
RefSeq (білок)
NP_001180
NP_031550
Локус (UCSC) Хр. 4: 13.54 – 13.54 Mb Хр. 5: 41.92 – 41.92 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NKX3-2 (англ. NK3 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 333 амінокислот, а молекулярна маса — 34 814[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAVRGANTLTSFSIQAILNKKEERGGLAAPEGRPAPGGTAASVAAAPAVC
CWRLFGERDAGALGGAEDSLLASPAGTRTAAGRTAESPEGWDSDSALSEE
NESRRRCADARGASGAGLAGGSLSLGQPVCELAASKDLEEEAAGRSDSEM
SASVSGDRSPRTEDDGVGPRGAHVSALCSGAGGGGGSGPAGVAEEEEEPA
APKPRKKRSRAAFSHAQVFELERRFNHQRYLSGPERADLAASLKLTETQV
KIWFQNRRYKTKRRQMAADLLASAPAAKKVAVKVLVRDDQRQYLPGEVLR
PPSLLPLQPSYYYPYYCLPGWALSTCAAAAGTQ

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Tribioli C., Lufkin T. (1997). Molecular cloning, chromosomal mapping and developmental expression of BAPX1, a novel human homeobox-containing gene homologous to Drosophila bagpipe. Gene. 203: 225—233. PMID 9426254 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00520-9
  • Yoshiura K., Murray J.C. (1997). Sequence and chromosomal assignment of human BAPX1, a bagpipe-related gene, to 4p16.1: a candidate gene for skeletal dysplasia. Genomics. 45: 425—428. PMID 9344671 DOI:10.1006/geno.1997.4926
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tribioli C., Frasch M., Lufkin T. (1997). Bapx1: an evolutionary conserved homologue of the Drosophila bagpipe homeobox gene is expressed in splanchnic mesoderm and the embryonic skeleton. Mech. Dev. 65: 145—162. PMID 9256352 DOI:10.1016/S0925-4773(97)00067-1

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з NKX3-2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:951 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, P78367 (англ.) . Архів оригіналу за 9 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші